สิบปีหลังจากพิธีการรบ เด็กชายวัยรุ่นชื่อจูได ยูกิ (จาเดน ยูกิ) ออกเดินทางเพื่อเข้าร่วม Duel Academia (Duel Academy) ซึ่งตั้งอยู่บนเกาะห่างไกลนอกชายฝั่งของญี่ปุ่น ที่นั่นเขาได้พบกับเพื่อนนักเรียนและได้รับเพื่อนสองสามคน พร้อมด้วยศัตรูไม่กี่คน จูไดถูกจัดอยู่ในอันดับต่ำสุดของ Osiris Red (Slifer Red) แต่เขายังคงทดสอบทักษะของเขากับนักศึกษาและคณาจารย์เพื่อพิสูจน์คุณค่าของเขาในฐานะ Duelist และได้รับความเคารพจากทุกคนรอบตัวเขา
Yu-Gi-Oh! GX Season 1 เกมกลคนอัจฉริยะ GX ปี 1